天界。钱塘潮神贪杯醉酒，与娇艳的美人鱼在湖底嬉戏，于凡间掀起万丈巨浪，造成江岸万民死伤。月圆之时，太阴星君不忍生灵涂炭，乃现身制止，与潮神一言不合，战得难解难分。太阳星君亦介入，阴阳联手，共同对付潮神。使得凡间水患连连，掀起了更大的灾难。幸南海观音驾临，平息此灾祸，遂将谴钱塘潮神打入凡间，并命二神跟随下凡，降伏妖孽，解救苍生。太阳太阴遂此结下不解情缘。时逢凡间云州史家，夫人刘氏分娩在即，舅子刘三一连卜了三个纯阳卦，为此啧啧称奇。于此同时，男婴哇哇坠地，史天云降世（即太阳星君转世）……二十年后，鞑靼大将殷不凡与王妃姚明月联手叛变，推翻鞑靼王，并欲进军中原，一统天下。战火中，鞑靼公主波娜娜（太阴星君转世）目睹父王被杀，九死一生逃往中原寻求援助，期能报仇雪恨，复兴王室……此时，史天云在母舅刘三的陪同下，自云州赴京赶考，求取功名，并且展现奇才，一举拿下史无前例的“文武双状元”，并赚得“云州大儒侠”的响亮封号。功成名就的天云没忘进京前母亲的教诲，母亲一心要他争取功名，意在望其肩负寻找被奸臣罗织叛国罪名的父亲下落，并替史家一雪前耻的重责大任。史天云正欲大展身手之时，不料被奸臣所害，发配辽东，中途偶然获知皇帝有难，乃决意前往救驾。史天云因护驾有功，受封一字并肩王，承担起寻找日、月、人三剑的重要使命，并于某机缘下邂逅流浪中原的波娜娜，重续前世情缘。而刁蛮任性的意欢公主亦对天云一见倾心，恳请皇兄招为驸马，天云陷入为情所困之境……日、月、人三剑是用以启动秦皇墓、唤醒百万兵马俑的重要机关。得三剑者得天下，在诡秘的藏镜人指示下，金光罩体殷不凡、女暴君姚明月等妄想图谋天下之徒，在天云寻剑途中威逼、色诱，明暗兼施，设置各种障碍，伺机窃取三剑。史天云历经险境，终不辱使命，在个性冷酷的江东神捕冷霜子、天下三奇等武林侠客的大力协助下，与波娜娜一道，凭借太阳、太阴星君转世之身直取日、月双剑。此时持人剑在手的神秘藏镜人即将浮出水面，他的真实身份令当今圣上及史天云大吃一惊……

1942年，日本侵略者对重庆的大轰炸已经进入了第四个年头。侵华日军总司令冈村宁次意外的得到一个情报：在重庆西南的古刹华岩寺中藏有一件镇寺之宝--《贝叶金经》，在这部经书中还隐藏了一个惊天秘密。如果得到了这个秘密就可以让日军轻而易举的消灭整个国民党政府，以实现其占领全中国的狼子野心。为了得到《贝叶金经》，冈村宁次精心策划了一次代号“阿波罗”的作战行动，他特别派遣了由日本浪人组成的，日军王牌特工队“樱花小组”秘密潜入重庆，偷偷的把黑手伸向了西南第一古刹--华岩寺。通过各种渠道得知日军特工潜入重庆的消息后，为了粉碎日寇的阴谋，中共地下党组织、国民党中的爱国人士与华岩寺众僧侣与“樱花小组”展开了殊死搏斗，最后他们用鲜血和生命终于将《贝叶金经》完好无损的保护了下来。1942年，抗日战争进行到了非常艰苦的僵持阶段。日寇飞机对国民党中央政府的陪都重庆进行疯狂大轰炸已经是第四个年头了。刚刚得到天皇嘉奖的侵华日军总司令冈村宁次，意外获知了一个可以轻而易举消灭国民党中央政府的秘密，并已根据这个情报制定了代号“阿波罗”的详细计划。而且冈村宁次还亲自挑选了，代号“樱花小组”的特工小组，来完成这一计划。“樱花小组”是日军最王牌的特工行动小组。它的成员包括：光、明子、美亚和阿之四个年轻貌美的女孩子，还有一个总是黑纱罩面的小组首脑--“樱花一号”：藤原爱，她的另一重身份是天皇御妹！樱花小组这次的任务，是要到重庆市郊的古刹“华岩寺”里，盗取那儿的镇寺之宝《贝叶金经》1942年的一天，在重庆国民党军统局，局长办公室里，军统局长戴笠看着刚刚截获的一封日军密电，不知为什么，他预感到正有一场血雨腥风就要在自己身边爆发！这天，日寇飞机突然一改重点轰炸重庆市区的惯例，而是把炸弹扔在了重庆郊外的西南第一古刹“华岩寺”周围。这时惊慌逃散的人群中有一位衣着雅致端庄的中年夫人不停的大喊：“不要乱跑，快趴下！”并把一个孩子挡在身下，这时候一颗炸弹在她身边爆炸了。这位夫人被方丈怀空大师救起。原来她是东北军抗日将领解望东将军的遗孀施绪萍，从东北逃难至此，现在住在山脚下帮寺里浆洗衣物干杂活为生的柳氏、小叶子母女家。施夫人谢绝了怀空大师让她留在寺中调养的好意，带着丫鬟小凤回到了山脚下暂住的小叶子家。日本人这次不寻常的轰炸引起了“华岩寺”上下的警觉，怀空大师怀疑日本人是想偷镇寺之宝《贝叶金经》，并嘱咐爱徒赵云龙和智青严加防范。戴笠来到华岩寺，转达了蒋介石想在观音诞日来华岩寺作一场“护国息灾大法会”的事，怀空大师答应了下来。一天深夜，云龙和智青在大雄宝殿抓到一个偷东西的贼。经审问，那贼居然是想来投《贝叶金经》。得知经书没有丢失后，怀空大师为免多生事端，名众人将贼放走。那贼刚出山门不远便被一黑衣人一刀杀死。

宋莲生乃一江湖郎中，浪荡不羁医术高超，在长沙行医时巧遇绣庄庄主无双，被她深深吸引，于是在绣庄门前开起了门诊，并应允无双的请求帮助东林党购置大量伤药，违反了朝廷规定而面临死罪，由于九芝堂老板的妙计，宋莲生得以获救，后来又因此事与地痞齐大头结怨，抢救了闻世堂无能为力的病人，此堂名声大跌又遭仇视，更因为误会无双而离开长沙，地在途中发现当地闹瘟疫，疫算将蔓延至长沙，他即刻返回通知九芝堂大量购药，并控制药材销售，瘟疫得以控制，圣上欲赐堂号给立功的药房，闻世堂吴老太医的侄女如月使出坏招，令九芝堂名声受损。逢九芝堂药材短缺，无双患重病，宋莲生无奈 只得问闻世堂求助，如月又使用计谋令宋莲生被逐出长沙，无双亦带着支离破碎的心前往南京……宋莲生生性善良、好打抱不平，却在长沙被迫几度离返，可谓世事难料，人心叵测。

一家跨国制药公司“葛安公司”，与国内某沿海城市合作兴建了一座大型生物工程基地。西海医院院长徐谦，感觉到葛安在医院下属的肝病医疗中心干着某种非法药物实验的勾当，但对方组织极其严密，违法活动不着痕迹。徐谦又发现葛安的人还意图窃取自己的导师、在世界流行病领域享有盛誉的肝病中心主任凌知渊正在秘密研究的某项重大科研成果(“黑郁金香”病毒研究)。 　　职责和良知让徐谦决定查出黑幕。而最有效的办法就是让黑幕的操作者信任自己。此时，徐谦发现自己患了一种不治之症——肌肉萎缩症。他知道最多半年时间，他就将躺在病床上，而最多两年时间，他将辞别人世。徐谦义无反顾地上了葛安公司的“贼船”，经过一场对方精心策划的“考试”后，徐谦成了生物工程基地的CEO…… 　　葛安公司断定凌知渊手上的秘密研究具有极大的商业价值。于是他的女儿、高级流行病学专家凌子墨被从在国外的葛安总部派回了西海。她的身份是生物工程基地高级顾问，但总部的秘密意图，是让她慢慢接近其父手中的秘密研究，助其父一臂之力，并在她自己不知情的情况下，将医学情报透给葛安…… 　　凌子墨回到西海，发现自己深爱的徐谦变得世俗、陌生甚至可怕。此种情形下，凌子墨与以前的恋人、一个因嫉恶如仇颇具个性而显得不合时宜的律师汪晓寒渐渐走得较近，徐谦为了让自己深爱的女友能在自己死前重新找到感情归宿，刻意做出一些不近情理伤害凌子墨的事，令凌子墨痛苦万分。 　　与魔共舞的徐谦，忍受着女友和导师朋友同事的误会，忍受着身体的痛苦和心灵的折磨，将收集到的犯罪分子们的罪证，以“蜘蛛侠”的网名不断给凌子墨发去电子邮件，指引凌子墨慢慢勘破其中的种种“悬机”。徐谦成了一个特殊的卧底和两面人，他想通过这样的方式里应外合让凌子墨汪晓寒等人将犯罪黑幕大白于天下。 　　“黑郁金香”病毒即将大面积爆发，凌知渊和凌子墨父女二人联手攻关，欲抢在病毒爆发前彻底破译它的基因密码。一场对黑郁金香科研成果的争夺战开始倾于白热化。葛安不惜代价不择手段要获取凌知渊父女的基因图。而最后黄雀在后的竟是凌知渊的助手、一个表面医术平平实则是此中高手的虞雅琴！当凌子墨等人终于意识到蜘蛛侠其实是徐谦时，徐谦为了保护黑郁金香的珍贵资料和虞雅琴等人展开了殊死搏斗，最后壮烈牺牲…… 　　依据徐谦提供的重要证据，西海市市长一声令下，葛安公司的罪犯们被依法逮捕，无一漏网…… 　　而人们敬仰的医学专家凌知渊，为了抢救病人自己感染了病毒，献出了生命…… 　　美丽的海滨墓地前，人们络绎不绝地前来凭吊英雄，大海亦为之动容……

本剧将心理学、DNA鉴定学、犯罪现场学、刑事工程学等多门学科融为一体讲述连环撞击案、奸凶案、绑架案、变态枪杀案等一系列案件的侦破，惊雷震震，绝地厮杀　　这是尖端的高科技和现代犯罪的较量。这个战场没有硝烟，却惊雷阵阵。一群来自医学院和刑警学院的年轻人，颠覆了传统的侦讯方式，利用最尖端最前沿的高科技技术，察微析疑，拨开重重迷雾，将各种狡猾残忍的罪犯送上法庭。

一九二五年，奉系将领武擎天在蚌埠火车站兵败被俘，遭直系军阀孙啸秋枪决。武擎天女儿武剑羽立誓要为父亲报仇。武剑羽女扮男装和从小结义金兰的妹妹白露、楚丹丹、弟弟武忠诚以及父亲的忠心部属马云来到上海，途中巧遇上海青帮老大张树声之子苏继飞。马云利用京戏班演出机会刺杀孙啸秋失手被杀，苏继飞力劝武剑羽放弃复仇计划，但武剑羽绝不罢休。结果苏继飞一步步卷入这一场恩怨情仇之中，同时他和武剑羽之间也暗生情愫。

古城龙城，一夜之间风云变幻，奇案迭起。飞檐走壁属于黑暗的杀手，日本风魔家族忍者出现在龙城。随他而来，是一件件离奇的杀人案件。而神秘的忍者，只是混乱的序曲，真正的恐怖，正在缓缓拉开帷幕，龙城，必将成为正与邪，善与恶的决战舞台……　　黑暗之影，日本忍者风魔信、龙城探长，无能的徐山、总局女神探白衣魔术师林硕石、虚弱咳血手无缚鸡之力却能掌握人心的洛红城、还有千面女子洛红婴、温文尔雅的木偶王子薛染，各路英雄，烽烟并起，他们所有人的真正目的，就是一件见证了中华民族数千年变迁的神秘宝物，这件国宝，已经失踪千年之久，而据说这件神秘国宝真正的藏身之地，就在龙城。　　龙城群魔乱舞，却惊醒了一个已经沉寂许久的神探，正是当年龙城第一神探，成旭。这次龙城的混乱，终于让成旭打破自己不再出手的誓言，重新出山。渐渐地，所有不可一世的人物，都开始围聚在成旭身边。木偶之王薛染成了和成旭不死不休的劲敌。还有千面人洛红婴和智囊洛红城，似正似邪，游离在成旭身边，二人目的无人可知，神秘的七星组织更是把成旭当成唯一的眼中钉。归根结底，成旭变成龙城风暴的中心，只是一个原因，有能力破开迷雾，解开千年迷局，找到国宝下落的整个龙城就唯有成旭一人！　　是生是死，是胜是负，所有的秘密即将解开，一切的恩怨就要算清，千年迷局，已经到了破局之时。

一具无名男性尸体突然被发现于海边，警方在其身上发一张手机卡，里面的所有通讯来往都是保安周大强以方海程的妻子许如云的名义发的，但是许如云早已失踪，而之前约过周大强单独谈话的洛小糖觉得心有愧疚，决定无论如何都要查明真相找出杀人真凶。　　周大强的死，也使陆天扬和林向晚开始恐慌，两人因为此事闹得不可开交。当年林向晚为逼方海程离婚而机关用尽，她趁方海程不在家时，用给许如云过生日的名义把一直不安好心的周大强骗到了许如云家，灌醉他们后，拍了他们暧昧的照片，想以此要挟许如云离开方海程。因此陆天扬认为是林向晚怕事情曝露而杀害了周大强，而两人的怪异行为也让洛小糖起了疑心，为了不让洛小糖查出事情真相，林向晚极力讨好洛小糖，洛小糖为了深爱的方海程决定打破沙锅问到底，方海程知道了事实真相又会如何？林向晚究竟是不是陷害许如云和杀害周大强的真凶？

护国良将许精忠之子许三元，仁厚重诺，公主对他暗许芳心，但骨子里充满侠义之道的他看破了官场黑暗，离京出走，半路上却与聪明顽皮杀富济贫的江湖魔女童芊结下了不解之缘，柳飞腾极嫉妒许三元的才华…… 柳飞腾于是使出种种卑鄙手段对许三元加以陷害，公主由爱而恨，大发雷霆，誓将两人置而死地…… 柳飞腾挑唆江湖各派，武林豪杰不辨真伪决定采取血腥行动，江湖上从此刀光剑影，血雨腥风…… 躲过了官兵的重重通缉，却躲不过武林高手的层层追杀，又是一场血战，黑风派屠龙成功，许三元掉入深崖，童芊…

光绪年间，香河县知县马东阳被暗杀。西太后欲派身边御厨牛不耕接任知县，光绪反对。于是二人各派一厨子走马上任，分单双日坐堂审案。李保田扮演的神厨与御厨因为权势和厨艺展开了明争暗斗，全剧由两人争乌纱，比拼断案引出一连串啼笑皆非的故事。

1949年初，少奶奶陶素兰（严晓频 饰）撇下年幼的双胞胎女儿心心和爱爱，考取了航空公司侍应生。在新中国成立前夜，她与方杰（张光北 饰）在共产党员夏莲（宋茹惠 饰）启发下，参加了震惊中外的“两航起义”，然后飞赴刚刚解放的上海。女儿心心被奶妈收养，爱爱则被父亲带往台湾。多年后，已成为民航界业务骨干的素兰与离异的方杰结合，方的女儿慕云（罗丽杉 饰）与已改名白秋璇（茹萍 饰）的心心都考取了民航乘务员。文革中，素云受到很大冲击，白秋璇也因得罪造反派陈亦雄（刘之冰 饰）被发配到苏北农村，女儿高高由慕云照顾。文革结束后，秋璇返回单位，此时的高高早把慕云当成了母亲。又是数年过去了，在台湾做空乘的爱爱（茹萍 饰）偶然碰上了姐姐秋璇，陶素兰闻讯大喜过望......

民国年间，绸布庄少东家黄绍宁娶刘婉云为妻，不料新娘无故失踪。黄老夫人为传宗接代逼绍宁再娶，贫苦女秋荷为报恩嫁给绍宁，住进了被诅咒且灵异传奇不断的黄家大院，饱受惊悚及悲惨凄苦的折磨。　　陈父与黄家生意竞争失败含恨而死，陈文海立誓报仇！他凭借超人的胆识潜入瑞盛祥卧底，与黄家管家吴妈及黄家养女雁儿串通把黄家大院搅得天翻地覆。绍宁同父异母的弟弟绍华回乡认祖归宗，遭陈文海算计爱上嫂子秋荷。绍宁妻离子散，黄家被逼到断子绝孙的境地。陈文海利用绍宁的信任抢得黄家产业，并陷害绍宁，使其被投入死牢待斩。已被富家收养的秋荷倾囊而出帮绍宁脱罪。绍宁欲接秋荷回家却遭到雁儿百般阻挠，雁儿如愿嫁给绍宁成为黄家第三任新娘，终因难产而死，留下一个女婴。陈文海深爱雁儿，雁儿之死使他在世上再没一个亲人，他失去人性杀婴儿解恨，却不知这是他和雁儿的女儿。最后凭秋荷的大义和坚忍挽救了黄家，改变了陈文海的命运！